MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FTNF002-00 chromosome

Total Repeats: 34970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009749	A	8	8	24	31	100 %	0 %	0 %	0 %	169656467
2	NC_009749	A	9	9	33	41	100 %	0 %	0 %	0 %	169656467
3	NC_009749	A	6	6	136	141	100 %	0 %	0 %	0 %	169656467
4	NC_009749	CAA	2	6	176	181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169656467
5	NC_009749	ATT	2	6	208	213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656467
6	NC_009749	TAA	2	6	222	227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169656467
7	NC_009749	A	6	6	226	231	100 %	0 %	0 %	0 %	169656467
8	NC_009749	A	6	6	242	247	100 %	0 %	0 %	0 %	169656467
9	NC_009749	T	7	7	282	288	0 %	100 %	0 %	0 %	169656467
10	NC_009749	CAA	2	6	293	298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169656467
11	NC_009749	AGA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169656467
12	NC_009749	AGT	2	6	333	338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656467
13	NC_009749	AAG	2	6	358	363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169656467
14	NC_009749	TCA	2	6	385	390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169656467
15	NC_009749	AGA	2	6	435	440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169656467
16	NC_009749	TGT	2	6	495	500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169656467
17	NC_009749	AGC	2	6	525	530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169656467
18	NC_009749	TGG	2	6	585	590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169656467
19	NC_009749	GCAA	2	8	618	625	50 %	0 %	25 %	25 %	169656467
20	NC_009749	ATT	2	6	664	669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656467
21	NC_009749	TTA	2	6	689	694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656467
22	NC_009749	CAAGAT	2	12	721	732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	169656467
23	NC_009749	TGAT	2	8	770	777	25 %	50 %	25 %	0 %	169656467
24	NC_009749	GAA	2	6	907	912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169656467
25	NC_009749	A	6	6	994	999	100 %	0 %	0 %	0 %	169656467
26	NC_009749	CAG	2	6	1034	1039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169656467
27	NC_009749	GTAC	2	8	1057	1064	25 %	25 %	25 %	25 %	169656467
28	NC_009749	TAC	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169656467
29	NC_009749	CTA	2	6	1133	1138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169656467
30	NC_009749	GCTT	2	8	1153	1160	0 %	50 %	25 %	25 %	169656467
31	NC_009749	AAGAA	2	10	1181	1190	80 %	0 %	20 %	0 %	169656467
32	NC_009749	ATA	2	6	1202	1207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169656467
33	NC_009749	GTT	2	6	1216	1221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169656467
34	NC_009749	AAG	2	6	1266	1271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169656467
35	NC_009749	TGG	2	6	1359	1364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169656467
36	NC_009749	ATGC	2	8	1384	1391	25 %	25 %	25 %	25 %	169656467
37	NC_009749	GAT	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656467
38	NC_009749	TAAA	2	8	1474	1481	75 %	25 %	0 %	0 %	169656467
39	NC_009749	A	6	6	1508	1513	100 %	0 %	0 %	0 %	156501372
40	NC_009749	TAT	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501372
41	NC_009749	ATA	3	9	1625	1633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501372
42	NC_009749	AGTT	2	8	1686	1693	25 %	50 %	25 %	0 %	156501372
43	NC_009749	TGAT	2	8	1769	1776	25 %	50 %	25 %	0 %	156501372
44	NC_009749	TAA	2	6	1812	1817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501372
45	NC_009749	AGCA	2	8	1883	1890	50 %	0 %	25 %	25 %	156501372
46	NC_009749	CAA	2	6	1906	1911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156501372
47	NC_009749	TCA	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156501372
48	NC_009749	TAT	2	6	1923	1928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501372
49	NC_009749	ATG	2	6	1955	1960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501372
50	NC_009749	CTA	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156501372
51	NC_009749	A	7	7	2106	2112	100 %	0 %	0 %	0 %	156501372
52	NC_009749	AGA	2	6	2148	2153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501372
53	NC_009749	ATA	2	6	2270	2275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501372
54	NC_009749	ATT	2	6	2316	2321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501372
55	NC_009749	TAA	2	6	2400	2405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501372
56	NC_009749	GAA	2	6	2515	2520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501372
57	NC_009749	TCTA	2	8	2527	2534	25 %	50 %	0 %	25 %	156501372
58	NC_009749	ATA	2	6	2579	2584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501372
59	NC_009749	GTTT	2	8	2585	2592	0 %	75 %	25 %	0 %	156501372
60	NC_009749	ATT	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501372
61	NC_009749	TAA	2	6	2618	2623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501371
62	NC_009749	GAAT	2	8	2661	2668	50 %	25 %	25 %	0 %	156501371
63	NC_009749	A	7	7	2680	2686	100 %	0 %	0 %	0 %	156501371
64	NC_009749	TA	3	6	2703	2708	50 %	50 %	0 %	0 %	156501371
65	NC_009749	AGT	3	9	2733	2741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501371
66	NC_009749	TAA	2	6	2745	2750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501371
67	NC_009749	TATTTC	2	12	2819	2830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	156501371
68	NC_009749	CAC	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156501371
69	NC_009749	A	6	6	2900	2905	100 %	0 %	0 %	0 %	156501371
70	NC_009749	TGA	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501371
71	NC_009749	T	6	6	2929	2934	0 %	100 %	0 %	0 %	156501371
72	NC_009749	ATA	2	6	2935	2940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501371
73	NC_009749	T	6	6	2997	3002	0 %	100 %	0 %	0 %	156501371
74	NC_009749	ACC	2	6	3003	3008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156501371
75	NC_009749	AT	3	6	3022	3027	50 %	50 %	0 %	0 %	156501371
76	NC_009749	GAA	2	6	3040	3045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501371
77	NC_009749	TAT	2	6	3121	3126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656468
78	NC_009749	T	7	7	3142	3148	0 %	100 %	0 %	0 %	169656468
79	NC_009749	ATA	2	6	3205	3210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169656468
80	NC_009749	TAG	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656468
81	NC_009749	ATG	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656468
82	NC_009749	CAA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169656468
83	NC_009749	CTT	3	9	3417	3425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169656468
84	NC_009749	CATCT	2	10	3512	3521	20 %	40 %	0 %	40 %	169656468
85	NC_009749	TA	3	6	3563	3568	50 %	50 %	0 %	0 %	169656468
86	NC_009749	TTCTT	2	10	3584	3593	0 %	80 %	0 %	20 %	169656468
87	NC_009749	T	7	7	3612	3618	0 %	100 %	0 %	0 %	169656468
88	NC_009749	CTT	2	6	3659	3664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169656468
89	NC_009749	CTT	2	6	3684	3689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169656468
90	NC_009749	GAT	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656468
91	NC_009749	TCAA	2	8	3734	3741	50 %	25 %	0 %	25 %	169656468
92	NC_009749	CAAC	2	8	3773	3780	50 %	0 %	0 %	50 %	169656468
93	NC_009749	CCTTG	2	10	3782	3791	0 %	40 %	20 %	40 %	169656468
94	NC_009749	AAC	2	6	3832	3837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169656468
95	NC_009749	A	6	6	3856	3861	100 %	0 %	0 %	0 %	169656468
96	NC_009749	CTT	2	6	3888	3893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169656468
97	NC_009749	ATTA	2	8	3901	3908	50 %	50 %	0 %	0 %	169656468
98	NC_009749	ATG	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656468
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100	NC_009749	T	6	6	6694	6699	0 %	100 %	0 %	0 %	156501378
101	NC_009749	TC	3	6	6747	6752	0 %	50 %	0 %	50 %	156501378
102	NC_009749	AT	3	6	6770	6775	50 %	50 %	0 %	0 %	156501378
103	NC_009749	TTG	2	6	6803	6808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156501378
104	NC_009749	ATTAT	2	10	6832	6841	40 %	60 %	0 %	0 %	156501378
105	NC_009749	CAACA	2	10	6924	6933	60 %	0 %	0 %	40 %	169656469
106	NC_009749	TAAGAG	2	12	6969	6980	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	169656469
107	NC_009749	GTTT	2	8	6989	6996	0 %	75 %	25 %	0 %	169656469
108	NC_009749	TAA	2	6	7004	7009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169656469
109	NC_009749	TAA	2	6	7085	7090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169656469
110	NC_009749	TGA	2	6	7110	7115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656469
111	NC_009749	GA	3	6	7132	7137	50 %	0 %	50 %	0 %	169656469
112	NC_009749	TGA	2	6	7152	7157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656469
113	NC_009749	TTG	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169656469
114	NC_009749	AAAT	2	8	7196	7203	75 %	25 %	0 %	0 %	169656469
115	NC_009749	AGG	2	6	7209	7214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169656469
116	NC_009749	TGA	2	6	7230	7235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656469
117	NC_009749	TATG	2	8	7284	7291	25 %	50 %	25 %	0 %	169656469
118	NC_009749	TGTA	2	8	7293	7300	25 %	50 %	25 %	0 %	169656469
119	NC_009749	TTA	2	6	7323	7328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656469
120	NC_009749	GCT	2	6	7333	7338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169656469
121	NC_009749	TGGTTT	2	12	7401	7412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169656469
122	NC_009749	GA	3	6	7463	7468	50 %	0 %	50 %	0 %	169656469
123	NC_009749	TCA	2	6	7545	7550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169656469
124	NC_009749	ACA	2	6	7612	7617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169656469
125	NC_009749	TAA	2	6	7710	7715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169656469
126	NC_009749	TTG	2	6	7724	7729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169656469
127	NC_009749	T	6	6	7749	7754	0 %	100 %	0 %	0 %	169656469
128	NC_009749	CAG	2	6	7757	7762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169656469
129	NC_009749	TAT	2	6	7789	7794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656469
130	NC_009749	CT	3	6	7799	7804	0 %	50 %	0 %	50 %	169656469
131	NC_009749	TAT	2	6	7880	7885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501380
132	NC_009749	CAA	2	6	7898	7903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156501380
133	NC_009749	GAA	2	6	7909	7914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501380
134	NC_009749	A	7	7	7923	7929	100 %	0 %	0 %	0 %	156501380
135	NC_009749	TGG	2	6	7952	7957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156501380
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137	NC_009749	TGA	2	6	8060	8065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501380
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